O Bubble Shooter Challenge 2 obriga o jogador a ganhar pontos disparando bolhas coloridas que saltam como bolas e ficam penduradas no topo do ecrã de jogo. O jogador deve ligar uma bolha de projétil a duas bolhas iguais para criar uma linha que rebenta. As bolhas abaixo dessa linha caem e rebentam depois de chocarem contra as paredes laterais verticais do campo de jogo ou contra as paredes que separam as áreas marcadas com o número de pontos disponÃveis (50 | 100 | 250 | 100 | 50).
O jogador usa um disparador que contém a bolha de projétil principal e a seguinte disponÃvel. Também tem acesso a uma linha de mira composta por pontos coloridos que correspondem à cor do projétil principal. Utiliza os pontos para ajudar a alinhar o tiro com as bolhas da cor correcta nas linhas. Recebem multiplicadores de pontos de combinação por remoções consecutivas de linhas. As bolhas deslizam pelo campo de jogo. O jogo termina se uma bolha deslizar para baixo do fundo do ecrã.
O Desafio do atirador de bolhas 2 oferece um laser dourado que aparece após um número especÃfico de remoções de linhas consecutivas. O jogador pode disparar o laser através de quaisquer bolhas no campo de jogo para ganhar pontos.
O jogo também inclui uma tabela de classificação com 50 das melhores pontuações. O jogo pede ao jogador para adicionar um nome de utilizador e a sua pontuação ao quadro.