Hole Run 3D is een hypercasual, driedimensionaal loopspel dat op unieke wijze de klassieke techniek van het baksteenbreken benadert. Het spel bevat een wervelend magisch gat voor een rood-wit gestreepte bal die automatisch over een blauw, roze en paars spoor rolt dat boven een oranje achtergrond met kleurverloop hangt. In tegenstelling tot traditionele loopspellen stuurt de speler de beweging van de bal niet. In plaats daarvan passen ze de positie van het gat aan. Ze moeten creatieve strategieën gebruiken om de bal zo te bewegen dat hij het beste een pad op de baan kan creëren door gele en oranje blokken met verschillende vormen. Hun doel is om de bal een witgeruite finishlijn te laten bereiken.
De lucht, zwaartekracht of andere kracht die wordt gegenereerd door de wervelende beweging van het interieur zuigt de blokken snel in het gat, waardoor de speler alleen maar hoeft na te denken over de posities van elk blok en de rotatie van de kracht. Als ze hier niet in slagen, breekt de bal als een stuk verbrijzeld porselein. De gebroken stukken tonen het patroon van de bal aan de buitenkant en een effen rode kleur aan de binnenkant.
Hole Run 3D geeft de speler mogelijkheden om het uiterlijk van de bal te veranderen. Ze krijgen punten in de vorm van witomrande diamanten. Met deze diamanten kunnen ze andere skins kopen, waaronder een watermeloen of sinaasappel en een witte sneeuwbal.