Flipper Dunk 3D is een driedimensionaal sportspel dat basketbal en flipperen combineert. Het speelveld heeft de vorm van een flipperkast en is voorzien van een donkerblauwe achtergrond, een houten frame en een enkele grote flipper. Een basketbalhoepel hangt aan de linkerkant boven de flipper. Het doel van de speler is om zijn basketbal- en flippervaardigheden te tonen door in elk level een bal in de basket te dunken.
Het schot is extreem moeilijk. De speler moet geduld hebben en een uitstekende oog-handcoördinatie om hem te maken. Als de bal onder de flipper valt, moet hij opnieuw beginnen. Gelukkig worden ze op geen enkele manier gestraft in het spel. Ze gaan gewoon niet door naar het volgende level totdat ze het schot hebben voltooid.
Als ze het goed doen, wordt er gejuicht, verschijnen er sterren, valt er confetti op het scherm en gaan de hoepel en het net naar een nieuwe positie. De speler ontvangt blauwe edelstenen. Ze mogen hun winst ook vermenigvuldigen door naar een reclame te kijken. Ze kunnen de edelstenen gebruiken om willekeurige, unieke bal- en flipperskins vrij te spelen.
De mechanica van Flipper Dunk 3D kan sommige spelers frustreren. De bal kan bijvoorbeeld vast komen te zitten tussen het rechter uiteinde van de flipper en het houten frame. De speler moet de flipper snel op en neer bewegen om de bal los te krijgen en naar de linkerkant te laten rollen. In deze versie van Flipper Dunk is het ook niet mogelijk om met het toetsenbord te spelen. De speler moet dus nauwkeurig op het scherm klikken of tikken om de flipper goed te laten werken.
