Endless Bubbles is een point-and-click bubbelschietspel met een buitenaards invasiethema dat oneindig speelplezier biedt. De speler hoeft geen klok te verslaan of opdrachten uit te voeren. In plaats daarvan proberen ze de hoogst mogelijke punten te behalen totdat ze besluiten om te stoppen met spelen of totdat de bubbels op het scherm de bodem van het speelveld bereiken. Vervolgens proberen ze in een nieuwe ronde hun laatst behaalde score te overtreffen.
Het spel heeft ook geen traditionele boog, kanon of ringschieter met één of twee projectielen. De projectielbel bevindt zich in het midden onderaan het speelveld, met daaronder nog drie projectielen in het zicht. Deze opstelling geeft de speler de mogelijkheid om zich voor te bereiden op de volgende drie schoten. De speler verdient punten door een projectiel af te schieten op twee of meer bij elkaar horende bubbels die in rijen hangen.
Endless Bubbles bevat een energiespel. Een getal onder een gouden bliksemschicht links van de projectielen neemt af als de speler geen match maakt. Maar als de energie op is, hoef je niet bang te zijn dat het spel eindigt. De bubbels bewegen één rij naar beneden en de energie wordt automatisch gereset.
Hoewel het spel een futuristisch afvuurgeluid maakt als de speler schiet, bevat het ook aangename achtergrondmuziek. Bovendien geven de oppervlakken van de levendige, kleurrijke bubbels licht mee als ze door een projectiel worden geraakt, wat het spel ontspannend maakt.