Balance Puzzle is een informeel, op wetenschap gebaseerd puzzelspel. De speler probeert voorwerpen in evenwicht te brengen in stapels over meerdere levels in 15 categorieën tijdens het getimede spel. Als er voorwerpen van de stapel vallen of als de speler de voorwerpen niet op tijd kan stapelen, faalt de speler het level. Hij moet dan de categorie vanaf het eerste niveau beginnen. Ze kunnen de volgende categorie pas ontgrendelen als ze in elk level van de huidige categorie zijn geslaagd.
De speler krijgt een kleine groep voorwerpen om mee te beginnen. Bij elk nieuw level krijgen ze twee itemopties en kiezen ze er een om toe te voegen aan de volgende levelronde. Tijdens het spelen verdwijnt er snel een groene horizontale timerbalk van het scherm. De speler moet een goede oog-handcoördinatie hebben en ten minste een basiskennis van zwaartekracht en wrijving om te voorkomen dat voorwerpen van de stapel glijden of vallen.
Balance Puzzle geeft de speler echter meerdere kansen om een voorwerp terug op de stapel te leggen als het eraf valt, zolang de timer groen blijft. Je kunt ook een groene knop met een witte halfronde pijl gebruiken om de plaatsing van een voorwerp ongedaan te maken en het opnieuw te proberen.