Pac-Rat est un jeu d`arcade de type labyrinthe et puzzle, semblable à la classe Pac-Man. Un rat tente de manger des tranches et des roues de fromage cheddar dans des labyrinthes répartis sur six niveaux. Cependant, il est menacé par plusieurs chats qui rôdent. La tâche du joueur est d`aider le rat à rester en vie assez longtemps pour manger tout le fromage.
Dès que des voix d`enfants crient "Préparez-vous... allez !", le joueur doit faire preuve de stratégie et utiliser les éléments de chaque labyrinthe pour empêcher les chats d`attraper le rat. Il peut simplement faire preuve d`observation pour éloigner le rat de toute zone où se trouve un chat. Comme les chats chassent également le rat, le joueur peut lui faire manger l`une des roues pour obtenir un pouvoir qui transforme temporairement le rat en un monstre vert qui mange les chats. Lorsque le rat se transforme, les chats crient et s`enfuient. Lorsqu`il mange l`un d`entre eux, le fantôme du chat mort est forcé de retourner dans sa zone d`origine pour se ressusciter, ce qui donne au joueur le temps d`ordonner au rat de manger d`autres morceaux de fromage.
Pac-Rat offre deux autres fonctions de jeu utiles. Il propose des portails à gauche et à droite de chaque labyrinthe que le joueur peut utiliser pour transporter rapidement le rat d`un côté à l`autre. Le jeu offre également trois vies au rat. Lorsqu`il ne reste plus qu`une vie, le jeu permet au joueur de recommencer un niveau depuis le début sans l`obliger à rejouer tous les niveaux.