Jelly Quest Mania es un juego de tres en raya ambientado en una isla con zonas de temperaturas cálidas y frÃas. Como en juegos similares, el jugador conecta tres o más objetos del mismo tipo, en este caso gelatinas de colores, para eliminarlos del tablero. Deben recoger un cierto número de diferentes tipos de gelatinas que aparecen en la esquina superior derecha de la pantalla, como estrellas azules, cÃrculos naranjas y flores moradas, antes de que se les acabe el tiempo.
El juego cambia la forma del tablero en diferentes niveles, lo que significa que el jugador podrÃa tener que trabajar alrededor de huecos que no tienen ninguna forma unida a ellos. También bloquea algunas gelatinas bajo barras de metal. Cuando esto ocurre, el jugador no puede mover o usar las gelatinas hasta que las desbloquee haciendo coincidencias de conexión a su alrededor (es decir, moviendo dos gelatinas iguales en posición contra la bloqueada). Algunas gelatinas también cambian de aspecto porque se voltean en sus espacios en el tablero.
Si el jugador se queda sin movimientos, el juego reordena automáticamente las posiciones de todas las formas de gelatina. También ofrece al jugador la opción de comprar y utilizar potenciadores, como un martillo que elimina sólo una gelatina cada vez. Si el jugador gana, recibe hasta tres estrellas doradas y monedas.