Fit Cats ist ein Logik-Puzzlespiel mit einem Verschmelzungselement ähnlich wie 2048 und das Spiel Watermelon (Suika). Der Spieler wirft Katzenköpfe in verschiedenen Größen und Arten in einen offenen Karton, um jeweils zwei passende Köpfe zu größeren, neuen Arten zusammenzufügen. Das Hauptziel ist es, viele Punkte zu sammeln und alle Köpfe in die Schachtel zu bekommen. Das Spiel bietet ihnen auch ein sekundäres Ziel, nämlich Mäuse zu fangen, die an verschiedenen Stellen in einem Raum mit einem stark stilisierten postmodernen Thema auftauchen und verschwinden.
Der Spieler lässt einen Katzenkopf in die Schachtel fallen, indem er eine weiße, gestrichelte vertikale Linie benutzt, um den Fall zu steuern. Er kann in der oberen rechten Ecke des Bildschirms nachsehen, welcher Kopf als nächster verfügbar ist, um die Köpfe strategisch abzulegen. Da die Köpfe hüpfen und rollen, muss der Spieler die Schüsse sorgfältig lenken und timen, um zu verhindern, dass kleine Köpfe die Zusammenführung größerer Köpfe blockieren.
Anders als bei ähnlichen Spielen gibt es bei Fit Cats keine horizontale Warnlinie, die der Spieler niemals von den Köpfen überschreiten lassen darf. Stattdessen darf der Spieler nie zulassen, dass sich die Köpfe so hoch stapeln, dass einer über die Seitenklappen rollt, in den Raum fällt und unter den unteren Rand des Bildschirms fällt.
