Butterfly Shimai ist ein zeitlich begrenztes Spiel, das auf der Idee basiert, dass Schmetterlinge passende Geschwister oder Flügelpaare haben. Der Spieler muss identische Flügel auf einem zweifarbigen lilafarbenen Brett, das in einem nächtlichen Wald hängt, zusammenbringen, um wunderschöne Schmetterlinge zu erschaffen, bevor ein vertikaler Zwei-Minuten-Timer auf der unteren linken Seite des Bildschirms das leuchtende blaue Licht verbraucht.
Das Spiel verlangt vom Spieler, dass er die Flügel mit nicht mehr als drei leuchtenden weißen Linien verbindet. Dabei können sie nur benachbarte Paare und Flügel verbinden, die durch Lücken getrennt sind, durch die nur bis zu drei gerade Linien verlaufen können. Sie können sowohl realistische als auch Fantasieschmetterlinge erstellen. Zu letzteren gehören Schmetterlinge mit Federn und Blättern als Flügeln sowie Fledermaus- und Bienenkörper und Flügel.
Bufferfly Shimai fordert die Spieler heraus, indem es die erstellten Schmetterlinge in eine Ablenkung verwandelt. Sie fliegen weg, fliegen zurück oder schweben über dem Spielbrett. Außerdem sind die Flügel in einigen Levels sehr unauffällig und verschmelzen untereinander oder mit dem Hintergrund. Allerdings verlängert jede Paarung den Timer um ein oder zwei Sekunden. Außerdem liefert das Spiel kostenlos zwei Hinweise und zwei Mischungen. Braucht der Spieler mehr Hilfe, kann er sich durch das Anschauen von Werbevideos zusätzliche Tipps verdienen.
Für jede Paarung erhält der Spieler Punkte. Wenn er seine Aufgabe schnell erledigt, erhält er einen Zeitbonus in Form von Extrapunkten und die Wiederherstellung einiger oder aller Hinweise und Shuffles. Scheitert er in einem Level, muss er von vorne beginnen und versuchen, seine Höchstpunktzahl zu übertreffen, die das Spiel unter der aktuellen Punktzahl in der oberen linken Ecke anzeigt.