BoBoiBoy Galaxy Run ist ein laufender, seitlich scrollender Plattformer, der auf der beliebten malaysischen BoBoiBoy-Fernsehserie für Kinder basiert. Der Spieler beginnt als BoBoiBoy Fire. Er kann Energiepunkte im Spiel verwenden, um sich in andere Superhelden-Versionen von BoBoiBoy (Lightning und Earth) und andere Charaktere (Ying und Fang) zu verwandeln.
Das Spielprinzip ist einfach. Der Spieler steuert BoBoiBoy oder eine andere Figur, um durch eine Vielzahl von Terrains und Levels zu laufen, zu springen, zu rutschen und zu rennen. Die Figur muss zum Beispiel durch eine Wüste, ein Industriegebiet oder einen Sumpf laufen. Während des Laufs verfolgt das Spiel die Entfernung der Figur. Wenn der Spieler unweigerlich einen Fehler macht oder aus einem anderen Grund scheitert, muss er versuchen, seine letzte Bestleistung zu übertreffen.
Das Spiel bietet aber auch Missionen und Erfolge, die der Spieler mit Energiepunkten, die er während des Laufs und durch tägliche Belohnungen sammelt, erreichen kann. Die Missionen, die als graue horizontale Streifen erscheinen, die zu Beginn eines Laufs auf den Bildschirm gleiten, können den Auftrag enthalten, eine bestimmte Anzahl von Gegnern oder Bomben zu zerstören oder eine bestimmte Distanz zu erreichen.
BoBoiBoy Galaxy Run stellt den Spieler vor viele Hindernisse, darunter Sand- und Wassergruben, lila, stachelige Kristalle und verschiedene Gegner. Allerdings kann der Spieler die meisten von ihnen überwinden, indem er die Spielfigur zum Springen oder Sprinten anweist. Er feuert automatisch eine Waffe auf Feinde ab.