Treasures of te Sea er et match-3-puslespil, der fokuserer på jagten efter piratskatten på 40 niveauer af øde tropiske øer. Spilleren får en mission om at finde bestemte antal og typer af genstande pr. niveau på et bræt, der viser forskellige skatte og våben, herunder bomber, ædelsten, skriftruller, sværd, sprængstoffer og kister. De skal matche tre af de samme piratrelaterede genstande på en række eller kolonne for at fjerne brikkerne fra brættet.
Hvert niveau byder på en anden udfordring. Spilleren skal måske rydde et bræt for genstande, der ikke vedrører en mission, for at få de ønskede genstande til at dukke op på brættet. Spillet lader yderligere skjulte genstande falde ned fra toppen af brættet i de huller, der opstår ved at fjerne genstande. Nogle brætter har huller eller blokke, der forhindrer, at der kan dannes en linje. Spilleren skal arbejde uden om disse forhindringer.
Treasures of the Sea tilbyder booster-spil via powerups. Spilleren kan f.eks. bruge en ild og lyn powerup til at fjerne en række og en kolonne på samme tid eller en elektrisk powerup, der tilfældigt fjerner genstande med elektricitet. Hvis spilleren løber tør for træk, skal han/hun starte niveauet forfra.
