Space Zoo er et klodspuslespil, der indeholder dyr som polyomino-former. Spilleren skal stable faldende figurer til tårnlignende strukturer på en flydende platform i tre udfordringstilstande (stak, overlevelse og fangst). Når spilleren klarer sig godt, vinder han/hun point og mønter. De kan bruge pengene til at købe flere dyr.
I Stack-tilstand skal spilleren placere så mange dyr som muligt, før blokkene hober sig tilfældigt op og krydser en grøn laserlinje, der udsendes fra to generatorer over platformen. I Survival mode stabler de figurer, indtil de løber tør for liv. I Catch-tilstand stabler de dyrene hurtigt, før en gnistrende substans, der fylder skærmen fra bunden, når toppen af stakken. I alle tre tilstande mister spilleren point og liv, når blokkene falder ned fra siden af platformen.
Space Zoo giver spilleren nyttige værktøjer til at hjælpe dem med at stable blokke. De kan rotere og glide blokkene på plads. Spillet viser også en lodret lyssøjle for at hjælpe spilleren med at se bedre mod den mørke, stjerneklare baggrund.
