Connect Dots 2 er et puslespil, der udfordrer spilleren til at spore hvide linjer mellem blågrå prikker på mønstre, der svæver frit foran et bevægeligt stjernefelt på tværs af tre verdener og 16 niveauer pr. verden. Spilleren kan kun nå nye niveauer og verdener ved at låse dem op i successiv rækkefølge.
Spilleren skal udføre denne opgave uden at spore nogen linjer, som han tidligere har sporet mellem prikkerne. Hvert niveau har tids-, niveau- og verdensnumre over linjerne og prikkerne. De mønstre, der vises på banen, er skabt ved hjælp af en række forskellige former, herunder rektangler, firkanter og trekanter.
Så snart spilleren vælger en prik, viser Connect Dots 2 en gul pil, der hjælper spilleren med at spore mod den næste prik. Når de har sporet en sektion, bliver linjen turkis for at vise dem deres handlinger. Hvis spilleren sporer en sektion utilsigtet, kan de starte forfra ved at zappe alting med en gul laser, der vises, når de vælger dobbeltpil-knappen.