Bubble Queen Cat er et spil, hvor spilleren skal redde katte, der er fanget i bobler. Spillet præsenterer spilleren for en række farverige, forbundne bobler, der hænger fra toppen af et spillefelt i en bred vifte af mønstre foran gamle ruiner. Spilleren skal fjerne alle boblerne fra feltet, inden han løber tør for projektiler.
Spilleren får en ringformet skyder med to projektilbobler, som han til enhver tid kan bytte rundt på. Skytten har også en lasermålslinje, der skifter farve for at matche projektilet.
Bubble Queen Cat fjerner bobler, når spilleren skaber linjer med tre eller flere bobler af matchende farver. Spillet giver spilleren en masse nyttige boostere, der gør det nemmere og hurtigere at rydde banen. Disse boostere omfatter elektriske bobler, der zapper vandrette linjer, regnbuebobler, der gør et projektil til et projektil i en hvilken som helst ønsket farve, bombe- og dynamitbobler, der fjerner sektioner af bobler, og tordenbobler, der rammer tilfældige bobler med lynnedslag. Der er også unikke bobler, der fjerner bølger i retning af en kompaspil.
Når spilleren vinder et niveau, belønnes han/hun med point og op til tre guldstjerner markeret med poteaftryk. De får også mulighed for at øge boostere og mønter med daglige belønninger, præstationsgaver og et heldigt spin-hjul.