Destroy Base är ett skjutspel som fokuserar på militära strider mot terrorister och gisslantagare från en helikopter eller ett flygperspektiv under olika väder- och stridsscenarier. Spelaren eliminerar fiender, förstör byggnader och räddar gisslan. I detta förstapersonsskjutspel med dold vy visas spelarens avatar och deras vapen inte på skärmen. Istället är vyn ett kameraperspektiv på målområdet på ett rutnät som ligger under den dolda skytten.
Spelaren får till en början en 9 mm pistol. Efter ett lyckat uppdrag får de pengar för att uppgradera sin pistol. Uppgraderingsalternativen inkluderar en 9 mm Killer Gun, 4,6 mm Rapid - Fire, 5,56 mm Assault Rifle, 5,56 mm M614, 7,62 mm Destroyer, 7,62 mm Exterminator och Null Burning Blaster. De kan tredubbla den summa pengar de får i slutet av ett uppdrag med en X3-multiplikator om de tittar på en annons.
Destroy Base kräver inte att spelaren förstör hela basen. Spelet visar mål, till exempel ett visst antal fientliga soldater eller tillhörande maskiner, som ikoner nära det övre vänstra hörnet. Det tillhandahåller också olika hjälpsamma objekt, inklusive röda tunnor som spelaren kan använda för att spränga fienden i luften. En skademätare högst upp på skärmen visar en röd balk för att visa hur mycket av spelarens hälsa som återstår under ett visst uppdrag.
