Squirrel Bubble Shooter começa com muitas bolhas diferentes de cores diferentes no topo do ecrã. O jogador, que é um esquilo, ficará situado na parte inferior do ecrã. As bolhas são, por vezes, aglomeradas com outras bolhas da mesma cor. O personagem esquilo receberá uma bolha de uma cor específica. Atira essa bolha para o ar com uma bolha da mesma cor e uma vez que as bolhas colidem, todas as bolhas que se tocavam desaparecem. Depois de limpar todas as bolhas do ecrã, o nível foi completado e o jogador passa para o nível seguinte. A cada nível o jogador é recompensado com pontos, dependendo da rapidez com que o nível foi completado. Para que as bolhas apareçam, as bolhas devem estar a tocar em pelo menos três outras bolhas da mesma cor. Além disso, se outras bolhas coloridas estiverem presas ao fundo das bolhas estouradas, estas bolhas extra irão cair no chão do nível e estourar. O esquilo pode atirar uma bolha para onde quiser. Atirar a bolha a outra bolha ou mesmo saltar a bolha da parede primeiro é uma opção.
>br>O jogo tem um fundo de selva de cor brilhante que é acompanhado por música temática de selva. O jogo é divertido de jogar e mantém um ritmo de jogo rápido. O jogo recompensa os jogadores com pontos por jogo rápido, por isso não se esqueça de atirar as bolhas o mais rápido possível para atingir o próximo nível.