Mecha Run é um jogo de corrida casual que exige que o jogador, através de um stickman amarelo com uma cabeça grande, use alavancas para dirigir um mecha à volta, através ou por cima de obstáculos em várias pistas de obstáculos num local no oceano. O objectivo do jogador é ajudar o mech a chegar a um anel de chegada preto e branco no final da pista. Se algum obstáculo danificar demasiado o mech em qualquer nÃvel, o jogador tem de reiniciar o nÃvel.
As pistas de obstáculos têm paredes castanhas e cinzentas, lâminas de serra rotativas e outras ameaças. Depois de tantos nÃveis, o jogador também deve participar numa batalha de chefes. O jogador usa alavancas no mech para o mover para a esquerda, para o centro ou para a direita num percurso. Dito isto, nem sempre é possÃvel orientar o mech em torno de um perigo. Por isso, é preciso equipar habilidades, ferramentas e armas especiais. Por exemplo, podem equipar um bónus de onda de choque que envia um impulso que derruba paredes de blocos cinzentos, um poder invencÃvel que protege o mech ou um drone voador que lança bombas. As ferramentas e armas incluem um canhão de bolas de fogo, uma broca pontiaguda e um motor nitro.
Mecha Run fornece ao jogador novas ferramentas e armas após cada corrida bem sucedida. O jogador deve ver anúncios para equipar habilidades de bónus.