Hole Run 3D é um jogo de corrida tridimensional hipercasual que aborda de forma única a mecânica clássica de partir tijolos. O jogo apresenta um buraco mágico rodopiante à frente de uma bola às riscas vermelhas e brancas que rola automaticamente por uma pista azul, cor-de-rosa e violeta suspensa sobre um fundo laranja degradado. Ao contrário dos jogos de corrida tradicionais, o jogador não dirige o movimento da bola. Em vez disso, ajusta a posição do buraco. Tem de utilizar estratégias criativas para a mover de forma a criar um caminho na pista através de blocos amarelos e cor de laranja de diferentes formas. O seu objetivo é ajudar a bola a chegar a uma linha de chegada marcada a branco.
O ar, a gravidade ou outra força gerada pelo movimento giratório do interior suga rapidamente os blocos para o buraco, o que significa que o jogador só precisa de pensar nas posições de cada bloco e na rotação da força. Se falhar esta tarefa, a bola parte-se como uma peça de porcelana estilhaçada. As peças partidas apresentam o padrão da bola no exterior e uma cor vermelha sólida no interior.
Hole Run 3D dá ao jogador a oportunidade de alterar o aspeto da bola. O jogador recebe pontos sob a forma de diamantes com contornos brancos. Podem usar estes diamantes para comprar outros visuais, incluindo uma melancia ou laranja e uma bola de neve branca.