Stair Run is een click-tap racespel. De hardloper is een superheld of iemand in een superheldenkostuum die over een witte baan met veelkleurige randen in een diepblauwe lucht rent. De speler moet de renner helpen om hoge rode geometrische vormen en andere obstakels op zijn pad te overwinnen. Ze moeten ook een hoge eindscore halen op een regenboogkleurige trap aan het einde van het parcours waar de treden verschillende puntenvermenigvuldigers vertegenwoordigen.
De held begint automatisch met rennen op het moment dat de speler interactie heeft met het spelscherm. Ze verzamelen planken op het parcours die ze kunnen gebruiken om treden te maken die omhoog en over de obstakels gaan. De speler moet de planken plaatsen door op het scherm te klikken of te tikken, zodat de loper op tijd een obstakel kan omzeilen.
De speler hoeft de planken nergens aan vast te maken. Zodra de hardloper de top van een obstakel bereikt, kan de speler stoppen met het plaatsen van de planken. Het personage zweeft dan gewoon naar beneden naar het niveau van de baan.
Stair Run vereist van de speler een uitstekende behendigheid, coördinatie en timing om de planken op het juiste moment te plaatsen. Hij of zij moet ook een fantastisch inschattingsvermogen hebben om ervoor te zorgen dat het personage genoeg planken heeft tegen de tijd dat het het einde van de baan bereikt. De loper kan de trap niet oplopen. In plaats daarvan moet de speler herhaaldelijk klikken of tikken om planken te plaatsen en zo een zone met een hoge vermenigvuldigingsfactor te bereiken.