Super Buddy Run è un platform a scorrimento laterale, con corsa e salti, che offre un gameplay divertente e impegnativo in diverse ambientazioni bellissime ma letali.
L`obiettivo principale del giocatore è aiutare il protagonista a correre in diversi mondi. Il primo è un parco conosciuto come La Foresta, con un parco divertimenti o un luna park sullo sfondo e un percorso di corsa fatto di muri di pietra. Il gioco presenta anche un`area sotterranea cavernosa, nota come Vulcano, che presenta strutture tecnologicamente avanzate per il percorso di corsa e piattaforme metalliche, e una zona selvaggia e innevata, chiamata Islanda, che presenta strutture di ghiaccio tra foreste innevate.
Il giocatore deve anche raccogliere stelle e regali. Con le stelle si sbloccano nuove skin per i compagni, ad esempio un compagno che indossa una maschera nera contrassegnata da una stella bianca. Con i regali si raccolgono poteri speciali, come uno scudo protettivo a forma di bolla che protegge temporaneamente il personaggio da tutto ciò che si trova sul percorso. Possono anche utilizzare gli oggetti presenti sul percorso per spingere il personaggio buddy in avanti, come piattaforme a molla.
Super Buddy Run mette alla prova il giocatore con molti ostacoli che possono uccidere il buddy, tra cui api pungenti che volano sopra la testa, lame circolari e curve affilate e ferme che sporgono dal percorso, pozze d`acqua che possono far annegare il personaggio e colonne di mazza che emergono dall`acqua. Il compagno muore e il livello ricomincia anche se il giocatore urta accidentalmente la testa del personaggio contro una piattaforma.
