Squirrel Bubble Shooter inizia con molte bolle di diversi colori nella parte superiore dello schermo. Il giocatore, che è uno scoiattolo, sarà situato nella parte inferiore dello schermo. Le bolle sono a volte raggruppate con altre bolle dello stesso colore. Il personaggio scoiattolo riceverà una bolla di un colore specifico. Lancia quella bolla in aria verso una bolla dello stesso colore e una volta che le bolle si scontrano, tutte le bolle che si stavano toccando scompaiono. Dopo aver eliminato tutte le bolle dallo schermo, il livello è stato completato e il giocatore passa al livello successivo. Ogni livello il giocatore viene premiato con dei punti, a seconda di quanto velocemente il livello è stato completato. Affinché le bolle possano scoppiare, le bolle devono toccare almeno altre tre bolle dello stesso colore. Inoltre, se altre bolle colorate sono attaccate al fondo delle bolle scoppiate, queste bolle extra cadranno sul pavimento del livello e scoppieranno. Lo scoiattolo può lanciare una bolla fino a dove vuole. Lanciando la bolla contro un`altra bolla o anche facendo rimbalzare la bolla sul muro prima è un`opzione.
Il gioco ha uno sfondo colorato della giungla che è accompagnato da una musica a tema giungla. Il gioco è divertente da giocare e mantiene un ritmo di gioco veloce. Il gioco premia i giocatori con punti per il gioco veloce, quindi assicurati di lanciare le bolle il più velocemente possibile per raggiungere il livello successivo.