Mecha Run è un gioco di corsa casuale che richiede al giocatore, tramite uno stickman giallo con una grande testa, di usare delle leve per dirigere un mecha intorno, attraverso o sopra gli ostacoli in vari percorsi ad ostacoli in una località oceanica. L`obiettivo del giocatore è aiutare il mecha a raggiungere un anello di arrivo bianco e nero alla fine del percorso. Se un ostacolo danneggia troppo il mech in un livello, il giocatore deve ricominciare il livello.
I percorsi a ostacoli presentano pareti marroni e grigie, lame di sega rotanti e altre minacce. Dopo un certo numero di livelli, il giocatore deve anche partecipare a una battaglia contro i boss. Il giocatore usa le leve sul mech per spostarlo a sinistra, al centro o a destra su un percorso. Tuttavia, non può sempre dirigere il mech intorno a un pericolo. Di conseguenza, deve equipaggiare abilità , strumenti e armi speciali. Ad esempio, possono equipaggiare un bonus onda d`urto che invia un impulso che abbatte i muri grigi, un potere invincibile che protegge il mech o un drone volante che sgancia bombe. Gli strumenti e le armi includono un cannone a palla di fuoco, una punta di trapano appuntita e un motore di tipo nitro.
Mecha Run fornisce al giocatore nuovi strumenti e armi dopo ogni corsa riuscita. Il giocatore deve guardare le pubblicità per equipaggiare le abilità bonus.
