Happy Glass 3 è un gioco di logica e puzzle che presenta una fisica semi-realistica, un requisito di disegno e bicchieri antropomorfi. L`obiettivo del giocatore, in 25 livelli, è quello di rendere felici i bicchieri riempiendoli d`acqua dai distributori. Deve usare linee disegnate a mano fatte di punti per dirigere il flusso dell`acqua oltre gli oggetti e gli spazi vuoti che impediscono a un bicchiere di riceverla.
Il giocatore usa una matita per disegnare le linee sullo sfondo bianco della carta millimetrata. Deve disegnare lentamente e con attenzione, perché la matita segna la carta solo con punti neri. A differenza di altri giochi simili, il giocatore può disegnare e ridisegnare le linee dopo che l`acqua inizia a uscire da un distributore.
L`acqua, inoltre, scorre sotto forma di palline invece che di un flusso continuo, il che significa che il giocatore deve evitare che le palline cadano tra i punti della linea. Inoltre, le palline smettono di rotolare e scorrono a intervalli diversi. Questa azione può impedire all`acqua di cadere in tempo in un bicchiere sopra la linea di riempimento.
Happy Glass 3 premia fino a tre stelle quando il giocatore fa bene. Il gioco offre numerose sfide, tra cui oggetti difficili da disegnare e acqua che scorre in direzioni non vicine al bicchiere. Il giocatore deve affidarsi alla sua conoscenza della gravità e della fisica per trovare le soluzioni.
Il gioco premia anche il giocatore con monete. Queste monete vengono utilizzate in tre categorie (Acqua, Matita e Viso) per effettuare rispettivamente aggiornamenti di colore, design e atmosfera.