Fish Story 3 è un altro rompicapo ad abbinamento 3 della divertente ed emozionante serie Fish Story. Sul fondo dell`oceano, tra alghe, spugne, serpenti marini e tartarughe, il giocatore abbina tre o più oggetti identici sulle tavole, livello dopo livello, per completare i compiti di una sirena di nome Pearl. In genere raccolgono forme di vita marine e oggetti ed eseguono altre azioni. I giocatori ricevono fino a tre stelle per livello e monete.
Ci sono anche altri giochi.
Il giocatore crea strumenti potenti e riceve booster che lo aiutano a finire più velocemente, il che è importante perché riceve un numero limitato di mosse. Su un tabellone, possono creare esplosioni di linee e incroci e bombe arcobaleno abbinando più di tre pezzi e creando scenari di abbinamento unici. Possono anche utilizzare la meccanica di fusione per accoppiare due oggetti speciali e creare modi ancora più potenti per rimuovere e raccogliere gli oggetti. Inoltre, sul lato destro del tabellone, ricevono dei booster che permettono di scambiare o rimuovere pezzi per creare linee.
Ci sono anche dei regali per il giocatore.
Fish Story 3 offre al giocatore regali da parte di Pearl e altre ricompense quando raggiunge determinati livelli. Questi omaggi di solito danno monete e booster extra. I giocatori possono quindi utilizzare le monete per attivare e acquistare i booster.