Agent Walker vs. Skibidi Toilet è uno sparatutto tridimensionale in terza persona che mette il giocatore in situazioni mortali in 10 livelli del mondo animato di Skibidi Toilet. Nei panni di un agente cameraman in tuta bianca, a bordo di un mech walker robotico a quattro arti, il giocatore combatte i mostri di Skibidi Toilet utilizzando quattro delle sei armi disponibili alla volta, tra cui un fucile a canne mozze, un lanciarazzi, una spada in stile katana e una pistola Gatling portatile motorizzata.
Ci sono due armi: la prima è un`arma da fuoco e la seconda è un`arma da fuoco.
All`inizio il giocatore combatte contro i bagni Skibidi di base. Alla fine combatte contro varietà di Skibidi a ragno e a cinque teste e contro il G-Man dei bagni a livello di boss. Durante ogni combattimento, il giocatore può controllare il misuratore di salute del proprio avatar nell`angolo in alto a sinistra e il numero di monete raccolte sotto di esso. Può anche seguire gli spostamenti degli Skibidi Toilet tramite una mini-mappa nell`angolo in alto a destra.
Ci sono anche delle mappe che permettono di seguire gli spostamenti di Skibidi Toilets.
In Agent Walker vs. Skibidi Toilets, il giocatore può effettuare 14 potenziamenti alla salute dell`agente e alla sua capacità di attirare monete. È inoltre possibile potenziare la sua testa con vari tipi di telecamere, giochi arcade, altoparlanti e altri dispositivi elettronici, oltre ad alcuni oggetti non tecnologici come un trofeo. Se il giocatore vuole raddoppiare le proprie monete, deve guardare una pubblicità .