Water Sort Puzzle es un juego de lógica y clasificación. El jugador debe mover capas de bandas de lÃquidos coloreados en tubos de ensayo tipo laboratorio hasta que un lÃquido de color sólido llene cada recipiente.
El jugador sólo puede mover una de las bandas coloreadas de un tubo de ensayo a otro a la vez. El juego les da dos opciones de transferencia. Pueden clasificar el lÃquido en un recipiente vacÃo o verterlo encima de una banda en un recipiente semilleno con una banda superior del mismo color. El jugador sólo puede transferir colores iguales a tubos de ensayo que ya contengan lÃquido.
Water Sort Puzzle permite al jugador deshacer un movimiento hasta cinco veces por nivel. A diferencia de otros juegos similares, no penaliza al jugador ni le obliga a ver un anuncio. Mejor aún, si el jugador se queda atascado y se le acaban los movimientos, puede recargar el nivel por completo. En algunos niveles, también puede añadir un tubo de ensayo vacÃo adicional al campo de juego de forma gratuita.
El juego no recompensa al jugador hasta que haya separado todas las bandas de lÃquido en recipientes de un solo color sólido. Cuando esto ocurre, aparecen brevemente partÃculas de confeti en la pantalla.