Pipe Puzzle ist ein Logik-Puzzle-Spiel. Der Spieler muss Teile eines Rohrs, das an der Wand hängt, in verschiedene Richtungen drehen, um ein einziges, vollständiges Rohr zu bilden. Das Ziel des Spielers ist es, Wasser durch das Rohr und aus einem Schwimmbereich zu saugen.
Eine oder mehrere Personen schweben in Badeanzug oder Badehose am Boden eines Raumes, der nur aus einem zweifarbigen Rahmen besteht, der seitlich an der Wand hängt. In dem Moment, in dem der Spieler beginnt, die Positionen der einzelnen Rohrstücke zu verändern, beginnt das Wasser den Raum zu füllen. Wenn der Spieler die Rohre rechtzeitig umdreht, saugt ein automatisches System das Wasser das ganze Rohr hinauf und an einer Seite des Rahmens wieder heraus. Von der Oberseite des Bildschirms fällt eine eisähnliche Discokugel mit Konfetti herab, und die Schwimmer tanzen auf dem wasserfreien Boden des Rahmens herum.
Wenn der Spieler versagt, bleiben ein oder mehrere Schwimmer im Rohr stecken oder fließen an der Seite heraus, oder der ganze Raum füllt sich mit Wasser, das Wasser und die Schwimmer platzen oben heraus, und das Spiel setzt das Level zurück.
Bei Pipe Puzzle muss sich der Spieler die Form des gesamten Rohrs vorstellen und dann die Teile so anordnen, dass sie zusammenpassen. Der Spieler muss über eine ausgezeichnete Vorstellungskraft, eine fantastische Hand-Augen-Koordination und ein Gefühl für Timing verfügen, um die Aufgabe rechtzeitig zu lösen.
In einigen Levels muss der Spieler ein Stück Rohr von einem speziellen Bereich zu einem leeren Abschnitt ziehen, um die Aufgabe zu erfüllen. Es kann auch vorkommen, dass nicht alle Rohrabschnitte verwendet werden.
