Balance Puzzle ist ein wissenschaftlich fundiertes Puzzlespiel für zwischendurch. Der Spieler versucht, Gegenstände in Stapeln über mehrere Levels in 15 Kategorien während des Spiels auf Zeit zu balancieren. Wenn einige Gegenstände vom Stapel fallen oder der Spieler es nicht schafft, die Gegenstände rechtzeitig zu stapeln, scheitert der Spieler im Level. Er muss dann die Kategorie vom ersten Level an beginnen. Die nächste Kategorie kann erst freigeschaltet werden, wenn alle Level der aktuellen Kategorie erfolgreich absolviert wurden.
Der Spieler erhält zu Beginn eine kleine Gruppe von Gegenständen. Mit jedem neuen Level erhält er zwei Gegenstände zur Auswahl und wählt einen aus, den er in der nächsten Runde einsetzen kann. Während des Spiels verschwindet ein grüner horizontaler Timer-Balken schnell vom Bildschirm. Der Spieler muss über eine gute Hand-Augen-Koordination verfügen und zumindest ein grundlegendes Verständnis von Schwerkraft und Reibung haben, um zu verhindern, dass Gegenstände vom Stapel rutschen oder umkippen.
Abgesehen davon gibt Balance Puzzle dem Spieler mehrere Chancen, einen Gegenstand wieder auf den Stapel zu legen, wenn er herunterfällt, solange der Timer grün bleibt. Mit der grünen Rückgängig-Taste, die mit einem weißen, halbkreisförmigen Pfeil markiert ist, kann der Spieler eine vorherige Platzierung rückgängig machen und es erneut versuchen.