Zoom-Be 3, det tredje dungeon-crawl-platformspil i Zoom-Be-serien, starter med, at drengene endelig er inde i den onde organisations hovedkvarter. De føler stærkt, at de er nødt til at nå kontrolrummet for at lære mere om det projekt, der ændrede dem for evigt. Spillerens mål er at hjælpe dem med at søge fra bygning til bygning på 20 niveauer efter den vigtigste bygning, der huser rummet. Hvis de klarer sig godt, når karaktererne frem til det, og en forbløffende begivenhed finder sted. Spilleren låser også op for et særligt stjernebonusniveau.
Spilleren eller spillerne kan dirigere zombie-vennerne til at udføre mange af de samme ting som i det forrige spil, såsom at åbne døre og trykke på knapper. Den større ven sparker primært til ting for at fjerne forhindringer, mens den mindre ven sidder lavt på hug, hopper højt og bevæger sig hurtigt. I denne del står de to venner over for nye udfordringer. For eksempel skal de hente forskellige farvede nøglekort for at åbne elektroniske dørlåse.
Zoom-Be 3 tilbyder en udfordring med at samle hovedbeklædning ligesom det forrige spil. Spilleren eller spillerne kan samle et par dyremasker, dyreformede hatte, cowboyhatte, hjelme med horn, beskyttelsesbriller og endda genstande, der typisk bæres af indbrudstyve eller tyveknægte.