Squirrel Bubble Shooter starter med mange forskellige bobler i forskellige farver på toppen af skærmen. Spilleren, som er et egern, befinder sig i bunden af skærmen. Boblerne er nogle gange klumpet sammen med andre bobler af samme farve. Egern-figuren vil modtage en boble af en bestemt farve. Kast denne boble op i luften mod en boble af samme farve, og når boblerne kolliderer, forsvinder alle de bobler, der rørte hinanden. Når alle bobler er fjernet fra skærmen, er niveauet afsluttet, og spilleren går videre til det næste niveau. Hver niveau belønnes spilleren med point, afhængigt af hvor hurtigt niveauet blev gennemført. For at boblerne kan springe, skal boblerne røre mindst tre andre bobler af samme farve. Hvis andre farvede bobler er fastgjort til bunden af de bobler, der er sprunget, vil disse ekstra bobler også falde ned på gulvet i niveauet og springe. Egernet kan kaste en boble op hvorhen det vil. Det er muligt at kaste boblen mod en anden boble eller endda at lade boblen hoppe af væggen først.
Spillet har en lys, farvestrålende junglebaggrund, som ledsages af musik med jungletema. Spillet er sjovt at spille, og det holder et højt tempo i spillet. Spillet belønner spillerne med point for hurtigt spil, så sørg for at kaste boblerne så hurtigt som muligt for at nå det næste niveau.
