Happy Glass 3 er et logik-puslespil med semi-realistisk fysik, krav om tegning og antropomorfe glasvarer. Spillerens mål på 25 niveauer er at gøre drikkeglas glade ved at fylde dem med vand fra dispensere. De skal bruge håndtegnede linjer lavet af prikker til at lede vandstrømmen forbi objekter og huller, der forhindrer et glas i at modtage det.
Spilleren bruger en blyant til at tegne linjerne på den hvide grafpapirbaggrund. De skal tegne langsomt og omhyggeligt, fordi blyanten kun markerer papiret med sorte prikker. I modsætning til lignende spil kan de dog tegne og tegne streger igen, når vandet begynder at komme ud af en dispenser.
Vandet flyder også som kugler i stedet for en kontinuerlig strøm, hvilket betyder, at spilleren skal forhindre små kugler i at falde ned mellem stregpunkterne. Kuglerne holder også op med at rulle og flyde med forskellige intervaller. Denne handling kan forhindre vandet i at falde ned i et glas over påfyldningslinjen i tide.
Happy Glass 3 belønner op til tre stjerner, når spilleren klarer sig godt. Spillet giver dem masser af udfordringer, herunder objekter, der er svære at tegne rundt om, og vand, der flyder i retninger, der ikke er i nærheden af et glas. Spilleren skal stole på sin viden om tyngdekraft og fysik for at guide sine løsninger.
Spillet belønner også spilleren med mønter. Disse penge kan bruges i tre kategorier (vand, blyant og ansigt) til at opgradere henholdsvis farve, design og stemning.