Bubble Shooter Pro 3 er endnu en del af den sjove Bubble Shooter Pro-serie med endeløse boblespil. Spilleren skyder bobler, der glider ned ad spillepladen, med et bobleprojektil og en skyder. Boblerne kan glide i forskellige hastigheder, hvilket betyder, at spilleren er nødt til at skyde konstant for at forhindre en bunke. Boblerne falder kun væk fra rækkerne, hvis spilleren matcher tre eller flere af samme farve. Målet er at optjene så mange point som muligt, før rækkerne af bobler glider ned under en vandret linje i bunden af skærmen.
Spillet behandler boblerne som hoppebolde. De springer, når de rammer pointzoner, der i starten er markeret med 60 | 120 | 300 | 120 | 60 i bunden af banen. Hvis spilleren fjerner bobler efter hinanden, optjener han multiplikatorer, der øger de tilgængelige point i zonerne. Hvis de fortsætter med at skyde og fjerne bobler uden afbrydelse (dvs. skaber en stribe), optjener de ildkugler og bomber og endda en pointzone, der er "i brand". Multiplikatorerne øger pointene til 200 | 400 | 1000 | 400 | 200.
Bubble Shooter Pro 3 belønner også point, hvis spilleren overhaler andre online-spillere med en højere score. De tjener ekstra point, hvis de bruger boostere eller når specifikke nemme og middelmådige præstationsmål. Det kan f.eks. være, at man skal bruge et bestemt antal bombe- eller ildkugleboostere eller spille et bestemt antal dage i træk.