Space Zoo é um jogo de puzzle de blocos que apresenta animais como formas de poliominós. O jogador deve empilhar as formas que caem em estruturas semelhantes a torres numa plataforma flutuante em três modos de desafio (Empilhar, Sobreviver e Apanhar). Quando o jogador se sai bem, ganha pontos e moedas.
No modo Empilhar, o jogador posiciona o maior número possÃvel de animais antes de os blocos se acumularem ao acaso e atravessarem uma linha de laser verde emitida por dois geradores acima da plataforma. No modo Sobrevivência, os jogadores empilham formas até ficarem sem vidas. No modo Apanhar, os animais são empilhados rapidamente até que uma substância cintilante que enche o ecrã a partir de baixo chegue ao topo da pilha. Nos três modos, o jogador perde pontos e vidas quando os blocos caem do lado da plataforma.
Space Zoo fornece ao jogador ferramentas úteis para o ajudar a empilhar blocos. Pode rodar e deslizar os blocos para a sua posição. O jogo também apresenta uma coluna vertical de luz para ajudar o jogador a ver melhor contra o fundo escuro e estrelado.
