Shape Shooter 3 è il prossimo divertente e nostalgico sparatutto in stile arcade della serie Shape Shooter. Il giocatore continua a cercare di sopravvivere agli attacchi di un`ampia gamma di forme singole e raggruppate di dimensioni, colori e capacità diverse su un campo di battaglia a griglia nera e grigia. L`obiettivo è guadagnare il maggior numero di punti e gestire il maggior numero possibile di ondate di attacchi.
Il giocatore inizia in modalità Normale. Se raggiunge un punteggio di 10.000, può sbloccare una modalità misteriosa (???). Si utilizza un caccia stellare simile a quelli presenti in Shape Crusher dello stesso sviluppatore. La prima nave spara proiettili di base, ha carburante illimitato e riceve protezione da uno scudo temporaneo. Il giocatore dirige la nave sul campo di battaglia. Quando spara a una forma verde, ottiene l`accesso a capacità extra. Può anche raccogliere pezzi di scudo azzurro per ripristinare uno scudo rotto. È sufficiente che il numero di pezzi sia indicato su una barra orizzontale al centro del campo.
Con il passare del tempo, Shape Shooter 3 offre al giocatore aggiornamenti automatici a nuove navi dotate di cannoni e capacità migliori o aggiuntive. Le armi potenziate di solito corrispondono alle armi temporanee equipaggiate dalle forme verdi e includono bombe, droni, granate, raggi laser, frese rotanti, proiettili a dispersione, raggi congelanti a fiocco di neve e trappole.
Se il giocatore raccoglie un numero sufficiente di monete sul campo di battaglia e guarda le pubblicità , può usare le monete per acquistare e sbloccare armi per qualsiasi nave. Inoltre, può continuare una battaglia dopo un incidente.