Come suggerisce il nome, Ocean Bubble Shooter porta il giocatore in una località sottomarina per sparare bolle colorate. Tuttavia, non si attiene al gameplay tradizionale. È un gioco di velocità che richiede al giocatore di sparare rapidamente. Il giocatore spara due o più bolle uguali con una bolla proiettile usando un tiratore fatto di un guscio d`ostrica e una freccia. A differenza di molti giochi simili, Ocean Bubble Shooter non prevede una linea di mira. Il gioco fa scorrere le file di bolle sul campo di gioco molto più velocemente rispetto ad altri tipi di giochi sparabolle. Di conseguenza, il giocatore deve puntare con attenzione la punta della freccia per effettuare tiri veloci e precisi.
Lo sparatutto fornisce al giocatore un suggerimento sulla bolla proiettata successiva per facilitare la ricerca di bersagli corrispondenti durante il completamento del tiro. I booster del gioco includono una bolla batteria che spara elettricità e abbatte molte bolle non corrispondenti e una bolla bomba che fa esplodere ogni bolla.
Nella maggior parte dei livelli, il giocatore deve sparare una bolla color arcobaleno per vincere. Il giocatore fallisce se una delle bolle collegate alle file scivola oltre il fondo del campo di gioco. Infine, è possibile inserire il proprio nome in una classifica per visualizzare il punteggio più alto.