National Geographic Kids: Bubble Burst è un gioco di bolle che sfida il giocatore a completare vari compiti in 20 livelli, esplorando al contempo fatti divertenti sulla natura e sul mondo. Il giocatore inizia con un capitolo sulla foresta pluviale. Il gioco presenta anche un capitolo sul futuro.
Il giocatore è rappresentato nel gioco da un avatar. Inizialmente è una raganella dagli occhi rossi. Completando con successo i livelli, il giocatore sblocca avatar conosciuti, tra cui un robot e un giaguaro.
A differenza di molti giochi di bubble-popping, il giocatore non deve abbinare tre bolle per rimuoverle dal campo di gioco. È sufficiente selezionare le bolle. Il giocatore crea bolle che contengono strumenti che rimuovono più bolle non abbinate in una sola mossa, tra cui bolle contenenti strumenti a forma di freccia e croce che agiscono come razzi orizzontali e verticali. Inoltre, crea un booster unico che agisce come tentacoli che fanno scoppiare una vasta gamma di bolle in tutte le direzioni. In alcuni livelli, ricevono una bolla di scuotimento che riorganizza le bolle intorno ad essa. Questi strumenti sono importanti perché il giocatore ha a disposizione un numero limitato di mosse.
Bubble Burst offre anche funzioni di potenziamento e superpoteri per ogni avatar. Quando il giocatore vince un livello, riceve degli smeraldi. Dopo aver acquisito 20 smeraldi, può potenziare il proprio personaggio. Durante il gioco, il potere del personaggio si ricarica a sufficienza e il giocatore può usarlo per far scoppiare le bolle più velocemente.
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