Bubble Shooter: Story è un gioco sparabolle in cui un allegro orso in mongolfiera viaggia verso masse terrestri fluttuanti attraverso 75 livelli di gioco. L`obiettivo del giocatore è aiutare l`orso a completare il suo viaggio eseguendo compiti di spara-bolle. Le bolle sono più simili a palline che rimbalzano. Anche se le bolle distrutte da un proiettile scoppiano al contatto, le altre cadono dal campo di gioco in vaschette sotto e intorno al tiratore. Il gioco assegna quindi punti, monete d`oro ed eventualmente monete bonus.
Ci sono due tipi di gioco
Il giocatore deve sparare una bolla proiettile colorata contro due o più bolle uguali collegate per rimuoverle dal campo. I compiti possono includere la rivelazione di luci nella fila superiore nascoste dietro le bolle, la liberazione di animali intrappolati nelle bolle o il tiro a bersagli rotanti. A volte il giocatore può usare dei booster per rimuovere le bolle. Può usare una bomba per eliminare più bolle, un proiettile della ruota dei colori per sparare a qualsiasi colore, una linea di mira per mirare meglio e un moltiplicatore per aggiungere cinque proiettili in più al totale disponibile. Il giocatore utilizza le vincite in monete per acquistare altri booster.
Bubble Shooter: Story è caratterizzato da un cannone a bolle invece che da un tiratore di frecce o anelli. Il giocatore può scambiare le bolle sotto il cannone per velocizzare le partite. Un numero sul cannone rivela il numero totale di proiettili disponibili. Quando il giocatore completa un compito, il gioco fa cadere automaticamente il campo di gioco rimanente e le bolle dei proiettili nelle ciotole.