Bloons TD 6, un gioco semi-idilliaco di difesa della torre, colloca il giocatore in una giungla dove il nemico combatte tramite palloncini. Il gioco offre sei mappe top-down da difendere (Monkey Meadows, Park Path, Town Center, Tree Stump, In the Loop e Downstream) e quattro modalità (Beginner, Intermediate, Advanced ed Expert). All`interno di ogni area, i palloncini nemici (bloon) arrivano a ondate, dette round. Il giocatore deve organizzare la propria difesa, che comprende una scimmia normale che lancia dardi, una scimmia di ghiaccio che congela e rallenta i palloncini, una superscimmia veloce che lancia proiettili, torrette che sparano punte in ogni direzione e cannoni che ruotano e sparano un`ampia raffica.
Con i nuovi round, i palloncini si riproducono con proprietà che li rendono più difficili da rompere. Le diverse mappe hanno anche diversi livelli di difficoltà . Il giocatore può aggiungere altre scimmie e oggetti alla propria difesa ed eseguire potenziamenti. Se non ha abbastanza soldi dai round precedenti per acquistare una particolare arma ad alto costo, può vendere qualsiasi membro della difesa sulla mappa in qualsiasi momento.
Bloons TD 6 è definito semi-idle perché il gioco esegue automaticamente entrambi i lati una volta che i bloon appaiono sulla strada e si avvicinano alla difesa del giocatore. Il giocatore può anche impostare il gioco in modo che esegua automaticamente il round successivo senza che il giocatore utilizzi il pulsante di gioco sullo schermo.
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