Alien Bubbles è un gioco arcade sparabolle che imita gli elementi del classico Puzzle Bobble (Bust-a-Move). Il giocatore deve impedire alle teste aliene rotonde e fluttuanti di toccare un dinosauro vicino al tiratore o il fondo del campo di gioco. Se gli alieni raggiungono il fondo dello schermo, esplodono e portano con sé tutto ciò che si trova nelle vicinanze. Se entrano in contatto con il dinosauro, lo trasformano in cenere.
Ci sono due obiettivi
L`obiettivo del giocatore è liberare lo schermo da tutti gli alieni e guadagnare punti. Il gioco presenta uno sparatutto ad ingranaggi con un`area di proiezione centrale progettata per una freccia di grandi dimensioni. Il giocatore dirige una freccia colorata verso una bolla del colore corrispondente. A differenza di alcuni sparatutto, il giocatore non deve eseguire una manovra di connessione o di abbinamento a 3. Deve solo sparare a singole teste con il colore corrispondente. Deve solo colpire singole teste con le frecce colorate di base del tiratore. Detto questo, è necessario sparare con precisione. Il gioco accelera la caduta di un alieno se il giocatore colpisce la testa con una freccia di colore diverso.
Ci sono livelli di gioco che offrono al giocatore la possibilità di giocare con le frecce di un colore diverso.
Alien Bubbles offre al giocatore livelli e gioco infinito. Offre anche opzioni di gioco veloce. Il giocatore può usare una freccia di cristallo bianca, color arcobaleno, per attraversare un`ampia fascia di teste non abbinate. Può anche usare una freccia esplosiva per far esplodere diverse teste non abbinate.
Ci sono due potenziamenti: il primo è la freccia e il secondo è la freccia.
Dopo aver eliminato tutte le teste aliene, il gioco offre loro nuovi sfondi e sfide.