Vega Mix 2 : Mystery of Island est un jeu d`aventure de type match-3 avec des thèmes d`exploration et de sauvetage. Un aventurier, Alex, disparaît sur une île tropicale après avoir déclenché un piège dans un ancien temple. Sa femme, Alice, et son amie, Vicky, décident de partir à sa recherche.
Le joueur doit gagner des mini-jeux de correspondance pour gagner suffisamment de monnaie dans le jeu pour débloquer des parties de l`histoire et aider les femmes à retrouver Alex. Chaque jeu de correspondance comporte des éléments que l`on trouve couramment dans les jardins potagers, tels que des couronnes de brocoli, des épis de maïs, des tomates entières, des gouttes d`eau et des outils de jardinage. Le joueur accomplit des missions, telles que la collecte d`un nombre spécifique de certains types d`objets, en réarrangeant les pièces pour créer des lignes d`au moins trois objets identiques.
La partie du jeu consacrée aux quêtes consiste à aider les femmes à accomplir des actions sur l`île, comme ouvrir un sac à dos, construire une hutte, visiter un village et sauver la faune locale. À chaque partie de match 3, le joueur gagne des pièces et des étoiles. Il utilise ces dernières pour débloquer chaque étape de l`aventure.
Vega Mix 2 met à la disposition du joueur de nombreux boosters utiles, notamment des fusées, des bombes, des fidget spinners et des fleurs arc-en-ciel. Ces outils permettent de supprimer rapidement des lignes, des colonnes, des sections et des éléments aléatoires des tableaux. Le joueur crée des boosters en associant quatre objets ou plus. Il reçoit également des boosters, ainsi que des pièces d`or et des vies infinies, sous forme de bonus quotidiens et de palmiers.