Santa Run ist ein endloses Rennspiel im Dash-Stil mit einem weihnachtlichen Thema. Der Spieler steuert eine Chibi-Version des Weihnachtsmanns vor dem Verkehr, Hindernissen und Bedrohungen, während er eine schneebedeckte Straße und Eisenbahnschienen entlangläuft, um Zuckerstangen und andere Gegenstände zu sammeln. Der Weihnachtsmann muss auch einen Waschbärdieb verfolgen, der eine Menge Gold gestohlen hat, das zur Feier der Weihnachtszeit beiseite gelegt wurde. Das Ziel des Spielers ist es, nützliche Gegenstände aufzusammeln, um neue Bereiche des Spiels freizuschalten und den Weihnachtsmann so lange wie möglich am Laufen zu halten.
Wie bei anderen Rennspielen im Dash-Stil beginnt der Lauf in dem Moment, in dem der Spieler mit dem Bildschirm interagiert. Der Spieler muss den Weihnachtsmann von riesigen Schneebällen fernhalten und ihn über oder unter schwarz-gelbe Bauhindernisse lenken. Im Spiel gibt es auch geparkte und fahrende Züge, um die der Spieler den Weihnachtsmann herum- oder hinüberfahren lassen muss, um Schäden zu vermeiden und Gegenstände zu bergen. Wenn der Weihnachtsmann mit einem gefährlichen Objekt in Berührung kommt, kann der Spieler das Spiel fortsetzen, indem er sich eine Werbung ansieht oder von vorne beginnt.
Santa Run bietet auch einen Turnieraspekt. Der Spieler kann die höchste Punktzahl verfolgen, indem er eine Schaltfläche mit einer Trophäe auf dem Startbildschirm auswählt.