Enchanted Waters ist ein Endlos-Laufspiel, bei dem der Spieler eine Spielfigur auf dem Bildschirm dabei unterstützen muss, auf Plattformen zu laufen, die in verschiedenen Wasserumgebungen schwimmen. Eine Umgebung kann eine helle Teichszene mit Treppen, die nirgendwohin führen, Wasser, das von oben aus Rohren fließt, und schwimmenden Enten und Blumen sein, oder eine dunklere Ozeanszene, die Seetang und die Silhouetten von Quallen, Haien, Fischschwärmen und anderen Meeresbewohnern zeigt.
Die Figur beginnt automatisch zu laufen, sobald der Spieler den Laufbildschirm aufruft. Der Spieler kann die Figur nicht lenken oder sie zu anderen Aktionen als dem Springen über Lücken zwischen Plattformen bewegen. Da die Figur schnell läuft, muss der Spieler schnell mit dem Spielbildschirm interagieren, um sie springen oder doppelspringen zu lassen. Der Doppelsprung erhöht sowohl die Höhe als auch die Distanz eines Sprungs. Wenn der Spieler zu lange oder nicht lange genug mit dem Bildschirm interagiert, fällt die Figur ins Wasser und das Spiel endet.
Glücklicherweise bietet Enchanted Waters kostenlose Wiederholungsversuche. Der Spieler wird nicht bestraft oder muss Geld bezahlen, um es erneut zu versuchen. Das ist ein großartiger Bonus, denn die Grafik des Spiels und die auf Magie basierenden Elemente machen den Erfolg unglaublich schwierig. Die Geschwindigkeit der Spielfigur ist nicht das einzige Hindernis. Es ist schwierig, die Abstände zwischen den Plattformen einzuschätzen. Die Spielfigur kann auch aufgrund von Illusionen plötzlich verschwinden. Magische Portale auf der Strecke können die Punktzahl verringern und die Figur in eine neue Umgebung schicken.
Das Spiel bietet kostenlose Münzen auf den Plattformen, mit denen der Spieler verschiedene Figuren und zufällig ausgewählte Booster kaufen kann, um den Lauf zu verbessern.