Dexomon ist ein rundenbasiertes, kampfarenenbasiertes Monstertrainingsspiel, das Pokémon und Dynamons ähnelt. In dieser ähnlichen Geschichte geht es um einen Jungen, der der beste Trainer von Monstern namens Dexomons werden will. Der Spieler hilft ihm, gegen wilde Monster und andere Trainer und deren Teams zu kämpfen. Sie helfen den Monstern, sich zu verbessern und neue Angriffe zu erlernen. Ihr Ziel ist es, die Monster des Jungen zum stärksten Team überhaupt zu machen.