In Cute Bubble Shooter, einem Spiel, in dem Blasen zum Platzen gebracht werden, muss der Spieler einer roten Sonne mit orange-gelben Blasen helfen, aus einem Feld mit Reihen bunter, gemischter Blasen zu entkommen, die anthropomorphe Gesichter und eine Vielzahl von Objekten enthalten. Der Spieler kann die Blasen um die Sonne herum nur entfernen, indem er Reihen von drei oder mehr Blasen mit Projektilblasen bildet, die aus einer schwarzen Kanone geschossen werden, die in der unteren Mitte des Bildschirms über einem blauen und weißen Hintergrund mit Farbverlauf schwebt.
Der Spieler muss nicht alle Blasen vom Spielfeld entfernen, um einen Level zu gewinnen. Er muss lediglich die Sonne befreien und erhält dafür Punkte. Das sekundäre Ziel in jedem Level ist es, durch das Platzen der Blasen Punkte zu sammeln. Ihr tertiäres Ziel ist es, die Blasen nicht unter eine rote horizontale Linie über der Kanone rutschen oder sich dort sammeln zu lassen.
Cute Bubble Shooter verlangt vom Spieler, dass jeder Schuss zählt. Er gibt dem Spieler fünf freie Durchgänge, die als gelbe Blasen links vom Shooter angezeigt werden. Wenn er es nicht schafft, eine Linie zu bilden, verliert er eine dieser Blasen, und die Stelle wird grau. Wenn er alle fünf verloren hat, fügt das Spiel zufällig zusätzliche Blasen auf dem Feld und in den Lücken um die Sonne herum hinzu. Außerdem werden die Durchgänge zurückgesetzt. Der Spieler kann weniger Fehlschüsse machen, indem er mit einer kleinen Vorschau des nächsten Geschosses direkt unter der Kanone strategisch plant.
Der Spieler verfolgt die Anzahl der Sonnen, denen er zur Flucht verhilft, in der oberen linken Ecke des Bildschirms. Die Punktzahl wird in der oberen rechten Ecke angezeigt.
