Ballbeez ist ein zeitlich begrenztes Logik-Puzzlespiel, das ähnlich wie die Spiele Happy Glass und Happy Filled Glass physikalische Herausforderungen bietet. Der Spieler muss dunkelblaue, rahmenartige Behälter mit Orbeez-Polymerkugeln füllen. Jede Kugel ist superabsorbierend, was bedeutet, dass sie von einer kleinen Größe zu einer größeren wächst, wenn sie mit Flüssigkeit in Berührung kommt. Der Spieler erhält drei goldene Sterne pro Stufe und verliert jedes Mal einen Stern, wenn eine Kugel aus dem Behälter und von der Tischoberfläche fällt.
Das Spiel hat 10 Levels mit jeweils fünf Etappen oder Behältern pro Level. Der Spieler benutzt einen oder mehrere Dispenser, die mit orangefarbenen Richtungspfeilen markiert sind, um die Orbeez in einen Behälter und ins Wasser zu werfen. Der Spieler muss genau abschätzen, wie viele kleine Kugeln er loslassen muss, damit sich die expandierten Kugeln so auftürmen, dass sie eine weiße, gestrichelte horizontale Fülllinie erreichen, oder er riskiert, dass der Behälter überfüllt wird. Das Spiel erschwert dies, indem es die kleinen Kugeln langsam oder schnell anschwellen lässt und sie dann in jeder Phase auf unterschiedliche Größen vergrößert. Außerdem stapeln sich die Kugeln schnell.
Ballbeez stellt den Spieler auch vor eine Vielzahl von Hindernissen. Der Spieler muss zum Beispiel Abschnitte in einem Behälter füllen, ein Loch in der Seite des Gerüsts blockieren oder einen Schiebespender benutzen. Trotzdem kann er eine Etappe gewinnen, wenn ein Ball nicht vom Tisch fällt, bevor ein weißer, doppelreihiger Timer eine bestimmte Zeit erreicht. Außerdem können sie es unbegrenzt oft wiederholen. Und wenn ein Abschnitt zu schwierig ist, kann er ihn überspringen, indem er sich ein Werbevideo ansieht.
