Enchanted Waters er et endeløst løbespil, hvor spilleren skal hjælpe en figur på skærmen med at løbe på platforme, der flyder i forskellige vandmiljøer. Et miljø kan indeholde en dagslys damscene med trapper, der ikke fører nogen steder hen, vand, der strømmer ud af rør ovenfra, og flydende ænder og blomster, eller en mørkere havscene, der afslører tang og silhuetter af vandmænd, hajer, fiskestimer og andet liv i havet.
Figuren begynder automatisk at løbe i det øjeblik, spilleren åbner løbeskærmen. Spilleren kan ikke styre figuren eller få den til at udføre andre handlinger end at springe over huller mellem platforme. Da figuren løber hurtigt, skal spilleren interagere hurtigt med spilskærmen for at få den til at hoppe eller dobbelthoppe. Dobbelthoppet tilføjer både højde og afstand til et hop. Hvis spilleren interagerer med skærmen for længe eller ikke længe nok, falder figuren i vandet, og spillet slutter.
Heldigvis tilbyder Enchanted Waters gratis gentagelser. Spilleren bliver ikke straffet eller bedt om at betale penge for at prøve igen. Det er en stor bonus, for spillets kunstværker og magibaserede elementer gør det utroligt svært at få succes. Karakterens hastighed er ikke den eneste forhindring. Det er svært at bedømme afstanden mellem platformene. Figuren kan også pludselig forsvinde på grund af illusioner. Magiske portaler på banen kan reducere scoren og sende figuren til et nyt miljø.
Spillet tilbyder gratis mønter på platformene, så spilleren kan købe forskellige figurer og tilfældigt udvalgte boostere til at forbedre løbeturen.
