Cubito er et arkadespil, endeløs runner, der indeholder elementer, der ligner slange-spil. Spilleren skal styre en slange eller et tog lavet af magenta terninger ned ad to spor lavet af neongrønne terninger, der hænger i et lilla område, der ligner det ydre rum. Deres eneste opgave er at holde terningerne på et af de to spor så længe som muligt for at opnå deres bedste score.
Som i slangespil kan spilleren miste terninger fra deres slange/tog, hvis de ikke formår at dirigere den uden om forhindringer på sporene, herunder lilla vægge og lyserøde barrierer. Banerne har også korte og brede huller, der kan gøre det svært for spilleren at vurdere afstande og tilgængelige resterende spor i et afsnit. Spillet har røde omvendte spor, der både er dødelige at røre ved og udvider og trækker de grønne spor sammen, hvilket gør det endnu sværere at vurdere hullernes placering. Derudover findes der hvide hastighedskubber med pile, der får spillerens kuber til at bevæge sig for hurtigt ned ad en bane.
Hver gang spilleren rammer en forhindring eller ikke formår at blive delvist på en grøn bane, mister han magenta terninger. Hvis deres terninger smækker ind i en forhindring eller falder gennem et hul, taber de spillet. De skal så starte forfra og forsøge at gøre det bedre end deres seneste bedste score.
Cubito giver spilleren et helbredende værktøj, der giver ham mulighed for at fortsætte på de grønne baner. Hver gang spilleren dirigerer terningerne gennem en magenta terning med et hjerte på, vokser hele slangen/toget tilbage til sin oprindelige størrelse.
