Puzzle Fever to klockowa gra logiczna, w której zamiast tradycyjnych kwadratów i elementów układanki występują sześciokąty. Jedynym celem gracza jest prawidłowe umieszczenie kształtów wykonanych z sześciokątnych bloków obok siebie lub ułożonych w stosy na planszach z pustymi sześciokątnymi polami na każdym poziomie. Gra oferuje setki poziomów w 14 trybach rozgrywki (Basic, Intermediate, Original 1, Colorful 1, Advanced, Expert, Genius, Master 1, Master 2, Original 2, Colorful 2, Crazy 5, Crazy 6 i Crazy 7).
Gracz wykorzystuje świadomość przestrzenną i koordynację ręka-oko do prawidłowego umieszczania przedmiotów. Nie musi się jednak martwić, jeśli popełni błąd. Gra pozwala na usunięcie umieszczonego kształtu i przeciągnięcie go z powrotem do pierwotnej pozycji pod planszą. Pozwala również graczowi na użycie półokrągłego przycisku strzałki, aby zresetować całe pole gry.
Puzzle Fever nagradza gracza złotą koroną na końcu każdego poziomu zamiast tradycyjnych trzech gwiazdek, które można zobaczyć w większości gier logicznych. Daje również graczowi monety, których może użyć do zakupu podpowiedzi, które pokazują, gdzie umieścić kształty podczas gry.
Dodatkowo gra oferuje graczom nagrody za ukończenie misji, takie jak przesunięcie bloków określoną liczbę razy, otrzymanie określonej liczby znaczków "Szybko!", a nawet ukończenie określonej liczby codziennych misji. Niektóre poziomy oferują również prezent. Gracz otrzymuje tę nagrodę dopiero po ukończeniu poziomu.