Tom and Jerry Run è un endless runner basato sui popolari cortometraggi animati di Tom e Jerry. Jerry, il topo, ha bisogno dell`aiuto del giocatore per sfuggire a Tom, il gatto, e raccogliere più formaggio possibile. I tappeti in stile runner della cucina, dei corridoi e di altre aree della casa servono come piste da corsa. Vari tipi di formaggio, tra cui spicchi e forme, fluttuano su diverse parti dei tappeti.
Ci sono due corse, una per il formaggio e l`altra per il formaggio.
Jerry inizia a correre automaticamente. Il giocatore deve dirigerlo a destra o a sinistra attraverso i pezzi di formaggio galleggianti. Deve anche fargli saltare e passare sotto gli ostacoli, come sedie e pedane. In alcuni casi, un mobile potrebbe avere qualcosa impilato sotto di sé, il che significa che il giocatore deve dire a Jerry di saltare sopra l`oggetto piuttosto che scivolare sotto di esso.
Se Jerry urta un ostacolo, il gioco si interrompe.
Se Jerry colpisce un ostacolo, la corsa termina. Il giocatore deve quindi ricominciare da capo e cercare di battere la sua ultima distanza e il numero di pezzi di formaggio raccolti.
Tom e Jerry Run offre un booster per aiutare Jerry a raccogliere il formaggio. Il giocatore dirige Jerry a correre attraverso un magnete galleggiante. Il booster attira quindi il formaggio verso Jerry. Il gioco offre anche uno strumento di rallentamento.
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