Destroy Base è un gioco di tiro a segno che si concentra su scontri militari contro terroristi e sequestratori di ostaggi da una prospettiva di volo o di elicottero durante vari scenari meteorologici e di combattimento. Il giocatore elimina i nemici, distrugge gli edifici e salva gli ostaggi. In questo sparatutto in prima persona con visuale nascosta, l`avatar del giocatore e la sua arma non vengono mostrati sullo schermo. La visuale è invece una prospettiva della telecamera dell`area bersaglio su una griglia situata sotto il tiratore nascosto.
Il giocatore riceve inizialmente una pistola da 9 mm. Dopo una missione riuscita, riceve denaro per potenziare la pistola. Le opzioni di aggiornamento includono una Killer Gun da 9 mm, una Rapid Fire da 4,6 mm, un fucile d`assalto da 5,56 mm, un M614 da 5,56 mm, un Destroyer da 7,62 mm, uno Exterminator da 7,62 mm e un Null Burning Blaster. Se guardano una pubblicità , possono triplicare la somma di denaro ricevuta alla fine di una missione con un moltiplicatore X3.
Distruggi Base non richiede al giocatore di distruggere l`intera base. Il gioco visualizza gli obiettivi, come un numero specifico di soldati nemici o di macchinari associati, sotto forma di icone nell`angolo in alto a sinistra. Fornisce inoltre vari oggetti utili, tra cui barili rossi che il giocatore può usare per far saltare in aria i nemici. Un misuratore di danni nella parte superiore dello schermo mostra una barra rossa per indicare la salute residua del giocatore durante una specifica missione.